แม่กับผัวใหม่เข้าใจว่า “ลับแล” ลูกชายถูกผีเข้าสิงจึงจับตัวลูกส่งไปอยู่วัด เพื่อให้หลวงพ่อขับไล่ผี แต่ลูกชายกลับเล่าเรื่องราวทั้งหมดที่เกิดขึ้นกับครอบครัวให้หลวงพ่อฟัง ตั้งแต่เรื่องบรรพบุรุษจนกระทั่งเรื่องว่าเขาคือคนที่ฆ่า “แก่งคอย” ซึ่งเป็นพี่ชายของเขาตาย โดยผลักให้ตกหน้าผา

ลับแล, แก่งคอย หากนับว่าเป็นเรื่องจริงและเรื่องแต่ง โดยนักเขียนได้แบ่งโครงเรื่องของนิยายออกเป็น 5 ภาค คือ ภาคแรก - กำเนิดจากเรื่องเล่า, ภาคสอง - ประวัติศาสตร์ที่เริ่มสว่าง , ภาคสาม - ในป่าหิมพานต์ ,

ภาคสี่ - ฌาปนกิจความจริง และภาคห้า - เถ้าอังคารของความลวง ลับแล, แก่งคอย ยังจัดเป็นนวนิยายแนวอัตชีวประวัติที่ผู้อ่านยากจะคาดเดาได้ว่าเรื่องราวจะจบลงเช่นไร